La Prison régionale de Bienne a été construite par l'architecte Franz Stempkovski en 1886. Elle comptait alors 35 places, et la partie centrale du bâtiment constituait le logement du chef de la prison.

Des travaux de rénovation et de transformations ont été entrepris en 1979, 1994 et en 2007 afin d'améliorer la sécurité et de moderniser les installations techniques et sanitaires. Les travaux de 1994 ont porté la capacité à 44 places.

La privation de liberté prise en charge par la Prison régionale de Bienne concerne les femmes, les hommes, et les jeunes.